Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO6Q96DC7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCO6Q96DC7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO6Q96DC7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms