Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRF1Q92994 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRF1Q92994 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRF1Q92994 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRF1Q92994 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms