Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSKUQ8WUA8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TSKUQ8WUA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKUQ8WUA8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms