Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCOLN3Q8TDD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCOLN3Q8TDD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCOLN3Q8TDD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms