Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD1Q8NHV4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD1Q8NHV4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD1Q8NHV4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEDD1Q8NHV4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms