Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFT2D3Q587I9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFT2D3Q587I9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms