Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIST2H2ACQ16777 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST2H2ACQ16777 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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