Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18Q15532 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18Q15532 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18Q15532 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18Q15532 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18Q15532 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18Q15532 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18Q15532 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18Q15532 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18Q15532 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18Q15532 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18Q15532 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18Q15532 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18Q15532 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18Q15532 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18Q15532 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18Q15532 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18Q15532 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SS18Q15532 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18Q15532 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18Q15532 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18Q15532 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18Q15532 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18Q15532 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SS18Q15532 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SS18Q15532 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18Q15532 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18Q15532 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18Q15532 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18Q15532 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18Q15532 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SS18Q15532 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SS18Q15532 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SS18Q15532 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18Q15532 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SS18Q15532 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SS18Q15532 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18Q15532 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18Q15532 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18Q15532 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18Q15532 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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