Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR6A1Q15406 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR6A1Q15406 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR6A1Q15406 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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