Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXM1Q08050 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXM1Q08050 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms