Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC5P78333 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC5P78333 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC5P78333 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC5P78333 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC5P78333 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC5P78333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC5P78333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC5P78333 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC5P78333 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC5P78333 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC5P78333 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC5P78333 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC5P78333 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC5P78333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC5P78333 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC5P78333 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPC5P78333 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPC5P78333 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC5P78333 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC5P78333 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC5P78333 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC5P78333 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC5P78333 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC5P78333 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC5P78333 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC5P78333 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC5P78333 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC5P78333 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC5P78333 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC5P78333 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC5P78333 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC5P78333 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC5P78333 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC5P78333 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC5P78333 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC5P78333 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC5P78333 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC5P78333 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC5P78333 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC5P78333 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC5P78333 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC5P78333 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC5P78333 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC5P78333 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC5P78333 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC5P78333 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC5P78333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC5P78333 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC5P78333 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC5P78333 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC5P78333 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC5P78333 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC5P78333 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC5P78333 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC5P78333 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC5P78333 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC5P78333 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC5P78333 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC5P78333 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC5P78333 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC5P78333 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
GPC5P78333 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC5P78333 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC5P78333 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC5P78333 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC5P78333 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC5P78333 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC5P78333 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC5P78333 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC5P78333 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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