Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GPC5P78333 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GPC5P78333 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GPC5P78333 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
GPC5P78333 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
GPC5P78333 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GPC5P78333 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GPC5P78333 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GPC5P78333 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GPC5P78333 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GPC5P78333 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GPC5P78333 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GPC5P78333 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GPC5P78333 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GPC5P78333 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GPC5P78333 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GPC5P78333 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GPC5P78333 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPC5P78333 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GPC5P78333 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GPC5P78333 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GPC5P78333 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GPC5P78333 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GPC5P78333 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GPC5P78333 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GPC5P78333 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GPC5P78333 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GPC5P78333 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GPC5P78333 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GPC5P78333 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
GPC5P78333 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GPC5P78333 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GPC5P78333 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GPC5P78333 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC5P78333 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC5P78333 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GPC5P78333 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GPC5P78333 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GPC5P78333 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GPC5P78333 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC5P78333 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GPC5P78333 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GPC5P78333 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GPC5P78333 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GPC5P78333 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GPC5P78333 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GPC5P78333 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GPC5P78333 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GPC5P78333 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GPC5P78333 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GPC5P78333 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GPC5P78333 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GPC5P78333 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GPC5P78333 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GPC5P78333 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GPC5P78333 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GPC5P78333 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPC5P78333 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GPC5P78333 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GPC5P78333 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GPC5P78333 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPC5P78333 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GPC5P78333 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GPC5P78333 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GPC5P78333 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GPC5P78333 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPC5P78333 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GPC5P78333 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GPC5P78333 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GPC5P78333 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC5P78333 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GPC5P78333 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GPC5P78333 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPC5P78333 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GPC5P78333 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GPC5P78333 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GPC5P78333 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GPC5P78333 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GPC5P78333 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GPC5P78333 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GPC5P78333 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GPC5P78333 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GPC5P78333 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GPC5P78333 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPC5P78333 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPC5P78333 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPC5P78333 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPC5P78333 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GPC5P78333 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GPC5P78333 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GPC5P78333 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GPC5P78333 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GPC5P78333 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GPC5P78333 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GPC5P78333 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPC5P78333 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GPC5P78333 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GPC5P78333 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GPC5P78333 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GPC5P78333 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms