Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF143P52747 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF143P52747 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF143P52747 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF143P52747 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms