Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN4P51793 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN4P51793 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN4P51793 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN4P51793 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN4P51793 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN4P51793 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN4P51793 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CLCN4P51793 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCN4P51793 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms