Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMDP50402 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMDP50402 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMDP50402 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMDP50402 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMDP50402 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMDP50402 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMDP50402 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMDP50402 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMDP50402 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMDP50402 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMDP50402 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMDP50402 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMDP50402 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EMDP50402 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMDP50402 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMDP50402 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMDP50402 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMDP50402 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMDP50402 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMDP50402 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMDP50402 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMDP50402 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMDP50402 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMDP50402 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMDP50402 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMDP50402 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMDP50402 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMDP50402 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMDP50402 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMDP50402 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMDP50402 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMDP50402 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMDP50402 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EMDP50402 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMDP50402 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMDP50402 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMDP50402 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMDP50402 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMDP50402 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMDP50402 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMDP50402 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMDP50402 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMDP50402 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMDP50402 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EMDP50402 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMDP50402 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMDP50402 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMDP50402 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMDP50402 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMDP50402 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMDP50402 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMDP50402 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMDP50402 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMDP50402 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMDP50402 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms