Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNA1P20827 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNA1P20827 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms