Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPGDP15428 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPGDP15428 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPGDP15428 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPGDP15428 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPGDP15428 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPGDP15428 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPGDP15428 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPGDP15428 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPGDP15428 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPGDP15428 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPGDP15428 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPGDP15428 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPGDP15428 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPGDP15428 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPGDP15428 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPGDP15428 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPGDP15428 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPGDP15428 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPGDP15428 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPGDP15428 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPGDP15428 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDP15428 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDP15428 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDP15428 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDP15428 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDP15428 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDP15428 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDP15428 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDP15428 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDP15428 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDP15428 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDP15428 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDP15428 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPGDP15428 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPGDP15428 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPGDP15428 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPGDP15428 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPGDP15428 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDP15428 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDP15428 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDP15428 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDP15428 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDP15428 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDP15428 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDP15428 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDP15428 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDP15428 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDP15428 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDP15428 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDP15428 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDP15428 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDP15428 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDP15428 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDP15428 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDP15428 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDP15428 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDP15428 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDP15428 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDP15428 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDP15428 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDP15428 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms