Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRM1P11229 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRM1P11229 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRM1P11229 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRM1P11229 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms