Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA5P08648 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA5P08648 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA5P08648 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms