Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI1P08151 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI1P08151 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI1P08151 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GLI1P08151 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GLI1P08151 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GLI1P08151 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GLI1P08151 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GLI1P08151 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI1P08151 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI1P08151 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI1P08151 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI1P08151 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI1P08151 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI1P08151 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI1P08151 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI1P08151 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI1P08151 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI1P08151 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI1P08151 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI1P08151 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI1P08151 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI1P08151 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI1P08151 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI1P08151 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI1P08151 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI1P08151 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI1P08151 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI1P08151 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI1P08151 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI1P08151 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI1P08151 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI1P08151 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI1P08151 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI1P08151 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI1P08151 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI1P08151 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI1P08151 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI1P08151 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI1P08151 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI1P08151 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms