Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDST3O95803 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDST3O95803 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDST3O95803 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDST3O95803 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDST3O95803 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDST3O95803 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST3O95803 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDST3O95803 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST3O95803 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDST3O95803 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDST3O95803 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST3O95803 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST3O95803 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDST3O95803 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDST3O95803 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NDST3O95803 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDST3O95803 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDST3O95803 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDST3O95803 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDST3O95803 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms