Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IKBKBO14920 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
IKBKBO14920 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IKBKBO14920 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms