Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA2E9PIF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA2E9PIF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA2E9PIF3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms