Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP69A5D8W1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP69A5D8W1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms