Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf49A4QMS7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf49A4QMS7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms