Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00854A0A1B0GVQ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00854A0A1B0GVQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 742.7 ms