Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.024e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PAK4-210ENST00000599657 534 ntTSL 421.32■■□□□ 14e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.974e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 420.67■□□□□ 0.94e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.764e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.714e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.74e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 519.21■□□□□ 0.674e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.624e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt18.63■□□□□ 0.574e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 217.77■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.354e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-205ENST00000465559 677 ntTSL 317.2■□□□□ 0.344e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.274e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-210ENST00000474345 713 ntTSL 316.74■□□□□ 0.274e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-213ENST00000489003 976 ntTSL 216.74■□□□□ 0.274e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.264e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-216ENST00000491013 912 ntTSL 516.32■□□□□ 0.24e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.24e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.14e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.064e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.054e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 04e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-219ENST00000495308 808 ntTSL 214.98□□□□□ -0.014e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 214.57□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-207ENST00000468479 938 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-204ENST00000461507 1022 ntTSL 214.08□□□□□ -0.164e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-211ENST00000477057 741 ntTSL 213.96□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-209ENST00000586201 881 ntTSL 313.8□□□□□ -0.24e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.254e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.314e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 411.06□□□□□ -0.644e-12■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 210.54□□□□□ -0.724e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 49.54□□□□□ -0.884e-12■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FDPS-209ENST00000471117 630 ntTSL 39.02□□□□□ -0.974e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-211ENST00000587299 1000 ntTSL 37.53□□□□□ -1.24e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 36.3□□□□□ -1.44e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 35.54□□□□□ -1.524e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.628e-8■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.638e-8■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.738e-8■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.838e-8■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.958e-8■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-48■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.694e-48■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 220.9■□□□□ 0.944e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 319.63■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP1A1-209ENST00000491156 666 ntTSL 29.02□□□□□ -0.971e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.669e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 CPNE7-203ENST00000525982 576 ntTSL 523.78■■□□□ 1.49e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.319e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.289e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TMEM165-205ENST00000508404 1657 ntTSL 222.96■■□□□ 1.279e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 522.6■■□□□ 1.219e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 MICALL2-212ENST00000487187 764 ntTSL 520.16■□□□□ 0.829e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 217.67■□□□□ 0.429e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 217.55■□□□□ 0.49e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.079e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 213.63□□□□□ -0.239e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.249e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.259e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 HECTD3-205ENST00000486132 2385 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.529e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.69e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 310.4□□□□□ -0.749e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TLN1-208ENST00000495712 370 ntTSL 28.03□□□□□ -1.129e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TMEM165-208ENST00000511710 731 ntTSL 38.02□□□□□ -1.139e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TMEM165-202ENST00000502797 639 ntTSL 36.31□□□□□ -1.49e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 CTSD-206ENST00000497544 783 ntTSL 222.03■■□□□ 1.122e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.283e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 APOM-201ENST00000375916 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 APOM-203ENST00000375920 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 APOM-202ENST00000375918 922 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.132e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.132e-11■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.243e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)6.62□□□□□ -1.353e-6■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.62e-7■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.751e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.621e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.431e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.351e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-9■□□□□ 9.6
PCBP1Q15365 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.811e-9■□□□□ 9.6
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