Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-11Q9UQG0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-11Q9UQG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-11Q9UQG0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-11Q9UQG0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-11Q9UQG0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-11Q9UQG0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-11Q9UQG0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-11Q9UQG0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK-11Q9UQG0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK-11Q9UQG0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms