Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC4AQ9UMR7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4AQ9UMR7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4AQ9UMR7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms