Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTBP2Q9UKA9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTBP2Q9UKA9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms