Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMSAP3Q9P1Y5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMSAP3Q9P1Y5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMSAP3Q9P1Y5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMSAP3Q9P1Y5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMSAP3Q9P1Y5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMSAP3Q9P1Y5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms