Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCFC1R1Q9NWW0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCFC1R1Q9NWW0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HCFC1R1Q9NWW0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCFC1R1Q9NWW0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms