Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX15Q9NRS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX15Q9NRS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX15Q9NRS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms