Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIRPQ9GZT3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLIRPQ9GZT3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms