Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF3BQ9BZI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF3BQ9BZI7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
UPF3BQ9BZI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPF3BQ9BZI7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms