Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA9Q9BWV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA9Q9BWV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA9Q9BWV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA9Q9BWV2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms