Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
FYCO1Q9BQS8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
FYCO1Q9BQS8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FYCO1Q9BQS8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
FYCO1Q9BQS8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms