Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC43Q96MW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC43Q96MW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC43Q96MW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC43Q96MW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC43Q96MW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms