Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf85Q96MD7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf85Q96MD7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms