Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC114Q96M63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC114Q96M63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC114Q96M63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms