Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD3Q96H12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD3Q96H12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD3Q96H12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms