Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP3Q96CW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP3Q96CW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBGCP3Q96CW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBGCP3Q96CW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms