Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MR1Q95460 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MR1Q95460 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MR1Q95460 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MR1Q95460 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MR1Q95460 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MR1Q95460 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MR1Q95460 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MR1Q95460 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MR1Q95460 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MR1Q95460 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MR1Q95460 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MR1Q95460 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MR1Q95460 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MR1Q95460 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MR1Q95460 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MR1Q95460 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MR1Q95460 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MR1Q95460 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MR1Q95460 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MR1Q95460 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MR1Q95460 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MR1Q95460 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MR1Q95460 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MR1Q95460 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MR1Q95460 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MR1Q95460 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MR1Q95460 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MR1Q95460 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MR1Q95460 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MR1Q95460 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MR1Q95460 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MR1Q95460 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MR1Q95460 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MR1Q95460 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MR1Q95460 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MR1Q95460 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MR1Q95460 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MR1Q95460 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MR1Q95460 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MR1Q95460 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MR1Q95460 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MR1Q95460 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MR1Q95460 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MR1Q95460 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MR1Q95460 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MR1Q95460 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MR1Q95460 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MR1Q95460 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MR1Q95460 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MR1Q95460 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MR1Q95460 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms