Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM3CQ92520 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM3CQ92520 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM3CQ92520 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM3CQ92520 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms