Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF169Q8NCN4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF169Q8NCN4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF169Q8NCN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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