Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC4Q8N9L1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZIC4Q8N9L1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC4Q8N9L1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZIC4Q8N9L1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms