Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A8

PLD6, Mitochondrial cardiolipin hydrolase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD6Q8N2A8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLD6Q8N2A8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD6Q8N2A8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD6Q8N2A8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD6Q8N2A8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD6Q8N2A8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD6Q8N2A8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD6Q8N2A8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms