Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGDCC3Q8IVU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGDCC3Q8IVU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGDCC3Q8IVU1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms