Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PPARGC1BQ86YN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PPARGC1BQ86YN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PPARGC1BQ86YN6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
PPARGC1BQ86YN6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms