Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC36A4Q6YBV0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.8 ms